在赛马娘中，种马和因子是两个非常重要的元素，种马是指玩家已经育成结束的马娘，玩家可以在每次育成时使用两位已经结束成为种马的马娘，而因子则是指影响马娘属性的因素，包括比赛因子、技能因子、剧本因子和白色因子等。
比赛因子可以提供技能打折和属性加成，技能因子只提供技能打折，剧本因子提供属性加成，URA因子提供随机1030的速度、耐力加成，白色因子在第二、第三次继承时随机出现，提高出现概率的直接方法是提高种马的相性。
游戏前期最重要的种马是9蓝色因子+9URA的种马，即祖辈的祖辈各有3个URA因子，祖辈自己带3个URA因子，合计9个，在游戏第二、第三次继承中，有更高概率让育成马娘继承大量的速度、耐力属性 。
| 因子类型 | 描述 | 最高星级 | 对应属性 | 影响因素 |
| 蓝色因子 | 基础属性因子，影响马娘的面板属性 | 3星 | 速度、耐力、力量、根性、智力 | 种马本身及父母辈的蓝色因子 |
| 粉色因子 | 距离、跑法、场地适性 | 不固定 | 距离、跑法、场地 | 种马与育成马娘的相性 |
| 绿色因子 | 三星马娘大招因子，影响技能等级 | 不固定 | 技能等级 | 种马本身及父母辈的绿色因子 |
| 白色因子 | 提供技能和属性，影响技能等级和属性 | 不固定 | 技能、属性 | 种马本身及父母辈的白色因子 |
种马相关描述：
| 种马属性 | 描述 |
| 种马相性 | 选择种马时，右上角显示的相性图标，影响粉色因子继承概率 |
| 九蓝种马 | 指种马及其父母辈的蓝色因子属性均为三星，共计9星 |
其他相关概念：
| 概念 | 描述 |
| 配种 | 选择种马和母马进行繁殖，影响马娘的属性、适性和技能 |
| 继承 | 育成过程中，马娘从种马和母马那里继承各种因子 |
| 三女神继承 | 指在特定阶段，马娘从父母辈种马那里必定继承一条三星蓝色因子 |
